Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ank1Q02357 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ank1Q02357 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms