Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms