Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms