Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sec23aQ01405 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms