Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms