Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2cQ01098 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms