Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms