Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms