Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SeleQ00690 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms