Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GabpaQ00422 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms