Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pax8Q00288 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms