Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PgrQ00175 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms