Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shc1P98083 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shc1P98083 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shc1P98083 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms