Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms