Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca2P97929 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca2P97929 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 329 ms