Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata5P97489 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms