Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkaP97477 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkaP97477 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkaP97477 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkaP97477 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkaP97477 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkaP97477 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkaP97477 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkaP97477 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkaP97477 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkaP97477 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkaP97477 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AurkaP97477 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AurkaP97477 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkaP97477 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms