Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms