Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RptnP97347 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RptnP97347 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RptnP97347 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RptnP97347 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RptnP97347 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RptnP97347 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RptnP97347 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RptnP97347 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RptnP97347 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RptnP97347 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RptnP97347 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RptnP97347 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RptnP97347 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RptnP97347 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RptnP97347 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RptnP97347 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RptnP97347 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms