Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Mesp1P97309 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mesp1P97309 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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