Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms