Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx3P81067 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms