Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx2P80206 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx2P80206 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx2P80206 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx2P80206 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otx2P80206 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms