Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms