Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux2P70298 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux2P70298 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux2P70298 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux2P70298 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux2P70298 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux2P70298 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux2P70298 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux2P70298 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux2P70298 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux2P70298 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux2P70298 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cux2P70298 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux2P70298 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cux2P70298 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms