Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcbP68404 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcbP68404 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms