Protein–RNA interactions for Protein: P63280

Ube2i, SUMO-conjugating enzyme UBC9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2iP63280 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2iP63280 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2iP63280 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms