Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms