Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps3P62908 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms