Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms