Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms