Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8bP61028 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8bP61028 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8bP61028 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8bP61028 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8bP61028 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8bP61028 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8bP61028 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8bP61028 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8bP61028 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms