Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sem1P60897 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms