Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap25P60879 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap25P60879 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap25P60879 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap25P60879 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap25P60879 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap25P60879 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap25P60879 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms