Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms