Protein–RNA interactions for Protein: P60122

Ruvbl1, RuvB-like 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ruvbl1P60122 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ruvbl1P60122 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ruvbl1P60122 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms