Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr3bP59470 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms