Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps5P59438 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hps5P59438 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hps5P59438 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms