Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf2P59222 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms