Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms