Protein–RNA interactions for Protein: P58406

Hrh3, Histamine H3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrh3P58406 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hrh3P58406 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms