Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpaP58389 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpaP58389 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpaP58389 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpaP58389 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms