Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp4P57724 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.7 ms