Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms