Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd38P56528 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd38P56528 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms