Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CdaP56389 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CdaP56389 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CdaP56389 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CdaP56389 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CdaP56389 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CdaP56389 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CdaP56389 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CdaP56389 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CdaP56389 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CdaP56389 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CdaP56389 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CdaP56389 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CdaP56389 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CdaP56389 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CdaP56389 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CdaP56389 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CdaP56389 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CdaP56389 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CdaP56389 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms