Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms