Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GemP55041 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GemP55041 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GemP55041 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GemP55041 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GemP55041 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GemP55041 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GemP55041 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GemP55041 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GemP55041 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms