Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms