Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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